Meilleur logiciel de comptabilité : test & comparatif 2025

Les meilleurs logiciels de comptabilité en 2025

1. Axonaut : le meilleur logiciel de comptabilité tout en un en 2025 

Fonctions comptables	Pré-compta, encaissements, TVA, export FEC
Facturation	Devis, factures, abonnements, relances
Gestion financière	CA, marges, trésorerie, tableaux synthétiques
Intégrations & ERP	CRM intégré, API, Zapier, export comptable
Modèle	SaaS français
Essai gratuit	Oui, 15 jours
Tarif « à partir de » indicatif	À partir de 19,99 €/mois/utilisateur
Retour d’expérience	Axonaut avis

Axonaut, c’est un logiciel français de gestion d’entreprise tout-en-un, qui regroupe facturation, CRM et gestion pré-comptable au sein d’une même plateforme. Pensé pour les TPE et PME, Axonaut vous permettra d’émettre devis et factures, de suivre les paiements de vos clients, de gérer vos contacts clients et fournisseurs, et même de piloter quelques fonctions RH ou de la gestion de projets !

La partie comptabilité d’Axonaut reste simplifiée : le logiciel assure le suivi de base (journal des ventes et achats, calcul de TVA, export des écritures au format FEC) mais c’est assez complet, et cela permet réellement de piloter votre activité.

Selon nous, Axonaut convient parfaitement aux petites structures qui souhaitent centraliser leur gestion commerciale et comptable sans complexité. Nous avons été séduits par son approche “tout-en-un” qui évite les doubles saisies et fait réellement gagner du temps au quotidien. Le tarif est en plus attractif. En revanche, si votre société a des besoins pointus sur un volet spécifique (comptabilité analytique avancée, CRM très poussé ou gestion de stock complexe), Axonaut montrera certaines limites. Il excelle dans la polyvalence, mais reste moins spécialisé qu’un logiciel dédié « métier ».

✅ Les avantages du logiciel de comptabilité Axonaut :

• Le côté « sait tout faire », tout-en-un (CRM, facturation, pré-compta, trésorerie, déclarations fiscales, gestion de projets, etc)
• Le compte pro gratuit, avec IBAN et plusieurs CB gratuites incluses,
• La prise en main rapide et facile malgré les nombreuses fonctionnalités,
• L’automatisation des rappels clients,
• La possibilité de solliciter des avances de trésorerie.

❌ Les inconvénients du logiciel de comptabilité Axonaut :

• L’absence de version gratuite,
• L’abonnement premium à 69 € HT / mois, qui peut être un peu cher pour les petites structures.

2. Sage : le meilleur logiciel de compta pour les groupes en croissance 

Fonctions comptables	Tenue complète, analytique, TVA, clôtures, multi-journaux
Facturation	Devis, factures, relances, e-facturation modulable
Gestion financière	Trésorerie, reporting, tableaux de bord personnalisés
Intégrations & ERP	Modules paie, CRM, immobilisations, multi-devises, API
Modèle	SaaS ou installation locale
Essai gratuit	Oui : 30 jours
Tarif « à partir de » indicatif	Sur devis selon modules, hébergement et nombre d’utilisateurs

Sage est un pionnier des logiciels de comptabilité. La suite Sage propose des solutions modulaires, de la comptabilité de base jusqu’à l’ERP complet. Ses fonctionnalités couvrent toute la gestion d’une entreprise : comptabilité et gestion commerciale (automatisation des écritures et états financiers), paie et RH, gestion d’entreprise et ERP, modules pour experts comptables, IA de gestion, etc. Le tout, conforme aux normes françaises. Le logiciel est disponible en local ou en cloud, et vous pouvez choisir quels modules vous souscrivez parmi les dizaines proposées, selon vos besoins.

Nous apprécions clairement l’exhaustivité et les intégrations proposées par Sage, même si pour le coup, Sage ne conviendra pas aux novices. Mais côté évolutivité, « c’est le top », la plateforme pouvant évoluer en véritable ERP. Selon nous, Sage conviendra donc aux PME en croissance, et aux besoins comptables avancés. Pas du tout adapté, donc, à un entrepreneur débutant ou une micro-entreprise. Mais si vous connaissez une croissance rapide, c’est parfait. Sage est en effet idéal pour une PME établie, dotée d’une équipe comptable, et qui recherche un logiciel de gestion financière tout en un et évolutif.

✅ Les avantages du logiciel de comptabilité Sage :

• Les fonctionnalités très larges,
• L’extrême niveau de personnalisation possible à travers les différents modules (il existe même un dédié au secteur du bâtiment nommé « Batigest »),
• La gestion multi-utilisateur, très efficace,
• La conformité fiscale, irréprochable,
• Une compatibilité avec de très nombreux outils métiers ce qui fait de Sage un écosystème très « intégrable ».

❌ Les inconvénients du logiciel de comptabilité Sage :

• Un coût élevé à l’usage,
• Une installation et une mise en route assez techniques,
• Une prise en main « pas évidente », une formation étant souvent indispensable.

3. Pennylane : le logiciel de comptabilité idéal pour les TPE et startups

Fonctions comptables	Écritures automatiques, synchronisation bancaire, TVA, liasse
Facturation	Devis, factures, notes de frais, etc
Gestion financière	Trésorerie en temps réel, rapprochements automatiques
Intégrations & ERP	CRM, banques, export expert-comptable
Modèle	100 % cloud
Essai gratuit	Oui, 15 jours
Tarif « à partir de » indicatif	À partir de 14 € HT/mois (indépendants), jusqu’à 199 € / mois
Retour d’expérience	Pennylane avis

Pennylane est une plateforme de comptabilité cloud conçue pour centraliser votre gestion financière. Elle combine comptabilité, facturation et suivi de trésorerie au sein d’une interface moderne, que vous prendrez en main facilement, même sans notions comptables. En résumé, vos comptes bancaires se synchronisent et vos factures s’enregistrent automatiquement, ce qui vous offre une visibilité immédiate. Pennylane embarque également un accès partagé aux données, pour que votre expert-comptable puisse travailler sur vos comptes sans souci.

Selon nous, Pennylane convient aux indépendants, TPE, start-ups et PME qui cherchent un outil moderne pour automatiser leur comptabilité. L’approche tout-en-un évite de multiplier les outils, et on apprécie le fait de pouvoir ouvrir un compte pro avec carte bancaire gratuite incluse. En revanche, la solution manque de certaines fonctionnalités avancées (analytique poussée, gestion de stock, paie intégrée ou CRM), ce qui la rend moins adaptée aux entreprises structurées. Enfin, la facturation par utilisateur peut revenir coûteuse pour les équipes nombreuses.

✅ Les avantages du logiciel de comptabilité Pennylane :

• Une interface moderne et claire, très facile à prendre en main,
• Le compte pro avec CB gratuite intégré,
• L’automatisation poussée (rapprochement bancaires automatiques, déclarations fiscales, etc),
• Une gestion intégrée des factures et notes de frais,
• Une collaboration fluide avec l’expert-comptable.

❌ Les inconvénients du logiciel de comptabilité Pennylane :

• Une couverture fonctionnelle encore incomplète,
• Certaines fonctionnalités essentielles (liasse fiscale par exemple), incluses seulement dans les formules supérieures,
• Le système de facturation « par utilisateur » qui peut s’avérer coûteux,
• Une gestion analytique limitée.

4. Indy : le meilleur logiciel de compta pour les indépendants

Fonctions comptables	Saisie automatisée, synchronisation bancaire, TVA, FEC
Facturation	Devis, factures, suivi clients
Gestion financière	Estimation impôts, trésorerie, app mobile
Intégrations & ERP	Export FEC, connexion expert-comptable
Modèle	SaaS
Essai gratuit	Oui, 30 jours
Tarif « à partir de » indicatif	Gratuit en Basic ; Premium de 16 à 59 €/mois selon structure
Retour d’expérience	Indy avis

Indy est un logiciel en ligne spécialisé pour les indépendants. Si vous êtes dans cette situation, Indy vous permettra d’automatiser votre tenue comptable. Notamment grâce au classement automatique des transactions bancaires, duquel découle vos déclarations fiscales, elles aussi générées automatiquement. Le service propose également un module de facturation et un tableau de bord de gestion, pour vous permettre en un coup d’œil de tout savoir de votre situation financière.

Selon nous, Indy est l’alternative idéale pour les indépendants qui souhaitent se passer d’un expert-comptable (ou y recourir de manière très ponctuelle). Nous apprécions particulièrement son interface, très épurée, et intuitive. Néanmoins, si vous êtes en pleine croissance, Indy montrera vite certaines limites : absence de paie, d’ERP ou de fonctions avancées. Au-delà d’un certain stade, il faut passer à un logiciel plus complet ou recourir à un expert-comptable.

✅ Les avantages du logiciel de comptabilité Indy :

• Une version gratuite déjà très complète,
• La tarification abordable sur les formules payantes,
• La facturation gratuite et illimitée,
• Un compte pro gratuit avec IBAN français et Mastercard incluse,
• L’ergonomie : Indy est très simple à utiliser,
• L’automatisation des déclarations fiscales.

❌ Les inconvénients du logiciel de comptabilité Indy :

• Pas de module de gestion salariale,
• Peu adapté aux sociétés structurées avec des employés.

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5. Cegid : le logiciel de gestion incontournable pour les PME dynamiques

Fonctions comptables	Comptabilité générale & analytique, TVA, fiscalité
Facturation	Devis, factures (module en option)
Gestion financière	Reporting, trésorerie, consolidation
Intégrations & ERP	Paie, CRM, multi-sociétés, stock
Modèle	SaaS
Essai gratuit	Non, mais possible démonstration sur demande
Tarif « à partir de » indicatif	À partir de 24,90 €/mois hors options.

Cegid est un éditeur français proposant des logiciels de gestion financière très complets. Sa solution de comptabilité pour PME offre une couverture fonctionnelle vaste : tenue comptable conforme aux normes françaises (TVA, fiscalité), comptabilité analytique et production automatique des états financiers. Cegid se distingue en outre par la qualité de ses modules complémentaires. Facturation, gestion commerciale, paie, consolidation, une myriade de possibilités, qui s’intègrent pour former un ERP unifié. 

Selon nous, Cegid vous conviendra si vos besoins sont très poussés, avec la nécessité d’une solution hyper paramétrable. En d’autres termes, si vous dirigez une PME très dynamique, un service public complexe, une entreprise industrielle, avec de nombreux comptes, salariés, et départements (RH, commercial, etc). Nous apprécions la richesse fonctionnelle de Cegid, ainsi que son adaptabilité (multi-filiales, multi-devises, etc). Cependant, sa prise en main est complexe et orientée experts.

À noter : si historiquement, Cegid est un logiciel pour les « grosses PME », une version Saas pour entrepreneurs et TPE est également disponible avec un pack de base gratuit et les fonctionnalités classiques de ce type de solutions (rapprochements bancaires, facturation, paie, CRM, etc).

✅ Les avantages du logiciel de comptabilité Cegid :

• Une des solutions les plus complètes du marché
• Une modularité imbattable,
• Un niveau de fonctionnalité qui convient aux grosses entreprises avec des services financiers intégrés,
• Une conformité réglementaire solide,
• Une intégration ERP native,
• Une fiabilité reconnue en PME.

❌ Les inconvénients du logiciel de comptabilité Cegid :

• Le coût global, élevé, et difficile à définir en amont (dépend des modules souscrits),
• Un déploiement technique complexe,
• Le temps d’adaptabilité des équipes qui peut être important,
• Un besoin fréquent d’assistance externe.

6. EBP : le logiciel de comptabilité pour petites structures

Fonctions comptables	Comptabilité française, immobilisations, TVA
Facturation	Devis, factures, relances
Gestion financière	Déclarations fiscales, trésorerie, comparatifs
Intégrations & ERP	Paie, gestion commerciale, export FEC
Modèle	Local ou SaaS (transition en cours)
Essai gratuit	Oui, souvent 30 jours (version Comptabilité PRO)
Tarif « à partir de » indicatif	En fonctions des modules, certains sur abonnement, d’autres sur devis

EBP Comptabilité est un logiciel français reconnu pour sa simplicité d’utilisation. Spécialement conçu pour les TPE/PME, il couvrira votre « compta courante », en conformité avec la réglementation française. Vos déclarations de TVA seront également gérées, ainsi que les états fiscaux. La force d’EBP, selon nous, c’est l’enrichissement possible de la solution avec des modules complémentaires (facturation, paie, gestion commerciale, etc).

EBP est ainsi l’une des meilleures solutions pour les petites entreprises qui souhaitent une comptabilité conforme « sans prise de tête », comme le clame le slogan de la marque. Nous apprécions sa facilité d’utilisation, calibrée pour les gérants de petites structures. À noter toutefois, EBP vient d’opérer son changement de modèle du logiciel vers le cloud. Quelques bugs sont donc à déplorer, mais nous sommes certains que cela se résorbera rapidement.

✅ Les avantages du logiciel de comptabilité EBP :

• Un bon compromis prix/fonctionnalités,
• Une solution pensée en France, et « pour la France » (conformité),
• Une nouvelle interface simple et intuitive,
• Une offre modulaire et évolutive.

❌ Les inconvénients du logiciel de comptabilité Sage :

• Une couverture cloud partielle (en progression),
• Des modules supplémentaires onéreux.

7. Tiime : le meilleur logiciel de compta pour les TPE

Fonctions comptables	OCR, pré-compta, synchronisation bancaire, TVA
Facturation	Devis et factures électroniques conformes
Gestion financière	Dépenses, alertes trésorerie, tableau simplifié
Intégrations & ERP	Export FEC, connexion expert-comptable MyUnisoft
Modèle	100 % SaaS
Essai gratuit	Version gratuite permanente
Tarif « à partir de » indicatif	Gratuit (10 factures/mois max, offres payantes pour besoins étendus)
Retour d’expérience	Tiime avis

Tiime, c’est un logiciel tout-en-un pensé pour simplifier la gestion administrative et comptable des petites structures, en particulier celles qui travaillent avec un expert-comptable. La solution vous proposera un outil de facturation 100 % gratuit et conforme (édition de devis et factures électroniques, envoi aux clients, suivi des règlements). Elle permet aussi de centraliser vos reçus et dépenses : il suffira de photographier vos justificatifs avec l’application mobile Tiime.

Tiime est par ailleurs connecté à votre banque, et votre comptable n’aura qu’à se connecter à son espace dédié pour récupérer toutes les données nécessaires.

Selon nous, Tiime se démarque par sa gratuité et sa simplicité, ce qui en fait un allié de choix pour les indépendants et dirigeants de TPE qui souhaitent :

• Dématérialiser leur facturation,
• Et alléger leurs tâches comptables quotidiennes.

Nous apprécions particulièrement le fait qu’une version gratuite, déjà très performante, soit proposée. Il ne s’agit pas d’une solution ultra poussée, mais pour une petite structure, est avec le complément d’un comptable, Tiime « fait très bien le job ». Et en plus, vous bénéficierez d’un compte pro gratuit avec CB incluse ! Et pour les entreprises plus développées, les versions payantes (smart et premium) offrent beaucoup plus de fonctionnalités.

✅ Les avantages du logiciel de comptabilité Tiime :

• Une offre gratuite et complète centrée sur la facturation,
• Le compte pro avec IBAN français et carte bancaire incluse,
• La gestion très pratique des notes de frais et indemnités kilométrique,
• Une solution « pensée » pour les gérants de petites structures.

❌ Les inconvénients du logiciel de comptabilité Tiime :

• La dépendance à un cabinet externe qui demeure,
• Un manque de fonctionnalités pour les entreprises importantes.

8. Dext : le meilleur logiciel de saisie comptable boosté par l’IA

Fonctions comptables	OCR, collecte automatique, classement intelligent
Facturation	Module basique, archivage sécurisé
Gestion financière	Dépenses, TVA, reporting, export vers autre logiciel
Intégrations & ERP	QuickBooks, Sage, Xero, Drive, Dropbox
Modèle	SaaS
Essai gratuit	Oui, 14 jours
Tarif « à partir de » indicatif	Version gratuite pour la facturation

Dext (ex-Receipt Bank) est un logiciel spécialisé dans l’automatisation de la saisie comptable. Plutôt que de remplacer votre comptable, Dext agit en amont pour éliminer les tâches manuelles de saisie. Il vous permettra ainsi de photographier ou d’envoyer vos factures et tickets de caisse, et en extraira automatiquement (grâce à l’IA) les informations comptables pertinentes (date, montant, TVA, catégorie). Ces données sont ensuite exportables ou synchronisées directement vers votre logiciel comptable principal. Dext propose également une interface web pour gérer et valider les dépenses, ainsi qu’un module de facturation.

Dext est un très bon outil pour optimiser votre « pré-compta ». Très pratique si votre entreprise traite un volume important de reçus et factures. Nous avons constaté un gain de temps considérable grâce à sa reconnaissance automatique et à l’élimination des erreurs de ressaisie. Dext s’intègre en outre parfaitement dans l’écosystème comptable existant, en communiquant avec la plupart de vos autres logiciels, ce qui le rend très flexible. De plus, sa nouvelle mouture web permet, en version gratuite, les fonctionnalités de base (traitement de vos documents comptables), mais va plus loin en version payante, avec l’automatisation de la saisie comptable.

✅ Les avantages du logiciel de comptabilité Dext :

• Une collecte automatique des pièces,
• Une saisie comptable ultra-rapide,
• La reconnaissance OCR boostée par IA, la plus efficaces du marché selon nous,
• Une bonne intégration aux logiciels comptables,
• L’interface, claire et intuitive.

❌ Les inconvénients du logiciel de comptabilité Dext :

• Le manque de la dimension « compta » en version gratuite,
• Un abonnement coûteux pour les gros volumes (69€ HT par mois pour 15 utilisateurs et 750 documents / mois).

9. Obat : le meilleur logiciel de gestion pour les pros du bâtiment ! 

Fonctions comptables	TVA multi-taux BTP, export comptable, conformité anti-fraude
Facturation	Devis chantiers, factures d’acompte/situations, bibliothèque d’ouvrages
Gestion financière	Suivi de chantier, marge, règlements, tableau d’activité
Intégrations & ERP	Planning, CRM, export vers cabinet
Modèle	SaaS spécialisé BTP
Essai gratuit	Oui, 14 jours
Tarif « à partir de » indicatif	De 32 à 129 €/mois selon formule
Retour d’expérience	Obat avis

Obat est un logiciel de facturation et de gestion conçu spécifiquement pour les professionnels du bâtiment (artisans, PME du BTP). Il se distingue par des fonctionnalités adaptées à votre secteur : création de devis détaillés à partir d’une bibliothèque d’ouvrages (avec main d’œuvre et matériaux), calcul automatique des taux de TVA spécifiques (10 % ou 20 % selon les travaux, avec attestations de TVA réduite intégrées), édition de factures d’acompte et de factures de situation pour suivre l’avancement des chantiers. Mais ce n’est pas tout, vous pourrez également, grâce à Obat, suivre vos marges par chantier afin de piloter votre rentabilité en tant réel. Également, un suivi de projet pour organiser chaque intervention.

Nous considérons qu’Obat est sans conteste le meilleur allié des entreprises du BTP. Si vous êtes dans le bâtiment, Obat peut clairement vous aider à « moderniser votre gestion ». Devis et facturation, bibliothèques d’ouvrages, CRM, planification financière et organisationnelle de chantiers, suivi pré comptable et financier, les fonctions ne manquent pas pour améliorer vos chiffres. Avec, en prime, un compte pro et une CB, directement intégré à votre logiciel, pour un rapprochement automatique précis des transactions.

✅ Les avantages du logiciel de comptabilité Obat :

• Un outil spécialisé pour le BTP, réellement orienté « métier »,
• Le compte pro, qui permet les rapprochements automatiques,
• La gestion multi-TVA intégrée,
• Les bibliothèques d’ouvrages, pratiques pour des devis en quelques minutes,
• Des modules de gestion de chantier et de planification financière très qualitatifs.

❌ Les inconvénients du logiciel de comptabilité Obat :

• Les tarifs : assez élevés, et pas de version gratuite,
• L’inadéquation hors secteur BTP.

Comparatif des logiciels de comptabilité

Voici un comparatif des solution précédemment évoquées :

Comment choisir le meilleur logiciel de comptabilité ?

Pour choisir le meilleur logiciel de comptabilité, mais surtout « celui qui vous correspond », vérifiez les critères suivants :

1. Évaluer vos besoins : taille de l’entreprise et secteur d’activité. Par exemple, un auto-entrepreneur n’a pas les mêmes exigences qu’une PME,
2. Fonctionnalités clés : lister les fonctions qui vous sont indispensables (facturation, TVA, paie, multi-devises, analytique…) et vérifier que le logiciel les propose,
3. Cloud ou local : un logiciel cloud offre mobilité et mises à jour automatiques, tandis qu’une solution locale apporte un contrôle interne et fonctionne même hors ligne,
4. Budget : comparer les tarifs (abonnement ou licence) et ce qu’ils incluent (utilisateurs, support, mises à jour). Des solutions gratuites ou économiques (Tiime, Indy) peuvent suffire lorsque vous débutez,
5. Intégrations : assurez-vous que le logiciel peut se connecter à vos autres outils (banque, CRM, e-commerce…) ou au minimum exporter les données vers votre expert-comptable. Plus un logiciel est intégrable dans votre environnement de travail, plus son utilisation sera « facile »,
6. Support et évolutivité : privilégier un éditeur réactif et une solution capable d’évoluer avec votre activité (ajout de modules, montée en gamme si nécessaire), ce afin de ne pas avoir à changer de solution en cours de route, ce qui est toujours un casse-tête !